从建站上来说，都没啥区别，操作上都一样。

比如：

主域名：zhudc.com

子域名（二级域名）：test.zhudc.com

二级目录：zhudc.com/test

这三个都能建站，而且都是独立的一个网站。

主域名很容易理解，正常的网址。

子域名与二级目录，常见的一般做多语言，语种要么在前面或后面，分开的不同网站。

在操作上，二级目录，可以直接建立文件夹开始建站。

而子域名，需要做解析，子域名不一定放在同一台服务器，你可以解析到其他服务器，特别是对多语种网站，选择离客户近的服务器创建网站效果更好。

所以

从建站流程上没什么区别，操作上也区别不大，只是用处不同而已。